外科は、呼吸器外科、消化管外科、肝胆膵外科、乳腺・内分泌外科、小児外科の5診療科から構成されています。
呼吸器外科は心臓外科以外の胸部疾患の外科治療を行います。
消化器疾患に関しては消化管外科が上部・下部消化器疾患を扱い、肝胆膵外科が肝疾患や胆道・膵臓疾患を扱います。
小児外科は新生児期〜学童期の呼吸器・消化器・泌尿生殖器・内分泌臓器およびその他の外科的疾患を扱います。
また、一般外科的疾患も診療や治療を行います。多くの外科的疾患については、内視鏡外科手術をはじめとする低侵襲性外科治療（minimally invasive surgery：MIS）を積極的に行える設備とスタッフを整えています。消化器疾患に伴う栄養療法や緩和医療、化学療法などもチーム医療の一環として取り組みます。
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